| id | 337 |
|---|---|
| protein family | SELENOT |
| protein name | Fr.cy-SELENOT-2-U |
| species name | Fragilariopsis cylindrus |
| seq length | 156 |
| cds location | 2406097..2405630 |
| secis location | 2399875..2399780 |
| dna sequence | GGTGGTGGCACTGGTGGCGACCATTCCGTCCATATCCAATTTTGTGTGAGCTGAGGGTCAAAACGTAACTTTCTTCAGGTAAGGGATTGGTTGGAACAAACCTTTCCGGAATTACGTGGGAAAGTTACGGGTGATAATTATCCACCACCACCAATAGCAGAATTATTAATGAAATTCTTATCTGTAATCCAATTAGCTGGGATGGCTGTCGCATTAATGGGTGAGAATGTATTTCGATTTATTGGTATGTCACGACCACCATCATGGTACGGTGATATTGTTGTAAAAAATGCTGTACCACTTGGTATTGGTCTATATTTGATTGTACCACAAATTCTGAATGGTTATATCGTATCGAATGCATTTGAGGTTGTATTAGATGGAACAGAAACTATCTTTAGTAAAATAGCAACAGGTCGGATGCCTGCAGCAGAAGATTTAATTGATCCATTAACTAGATTTGGTCTA |
| amino acid sequence | GGGTGGDHSVHIQFCVSUGSKRNFLQVRDWLEQTFPELRGKVTGDNYPPPPIAELLMKFLSVIQLAGMAVALMGENVFRFIGMSRPPSWYGDIVVKNAVPLGIGLYLIVPQILNGYIVSNAFEVVLDGTETIFSKIATGRMPAAEDLIDPLTRFGL |
| secis free energy | -4.49 |
| secis sequence | ACUCAUCGCU UCAUUAU GUUUUAUAAUUAU CUGAC CAAGAGCAUUG CC AGACUGCC UACUGUCCUU UCGAC UGUCCCCA GAAAAGG CGCACCAACU |
| est id | gi|282252484|gb|GW067017.1|GW067017,gi|66748813|gb|DR026450.1|DR026450 |
| est cds location | 187..654 |
| est secis location | |
| est dna sequence | ATGACG GGTGGTGGCGCTGGTGGCGACCATTCCGTCCATATCCAATTTTGTGTGAGCTGAGGGTCAAAACGTAACTTTCTTCAGGTAAGGGATTGGTTAGAACAAACCTTTCCGGAATTACGTGGGAAAGTTACGGGTGATAATTATCCACCACCACCAATAGCAGAATTATTAATGAAATTCTTATCTGTAATCCAATTAGCTGGTATGGCTGTCGCATTAATTGGTGAGAATGTATTTAGATTTACTGGTATGTCACGACCACCATCATGGTACGGTGATATTGTTGTAAAAAATGCTGTACCACTTGGTATTGGTCTATATTTGATTGTACCACAAATTTTGAATGGTTATATCGTATCGAATGCATTTGAGGTTGTATTAGATGGAACAGAAACCATCTTTAGTAAAATAGCAACAGGTCGGATGCCTGCAGCAGAAGATTTAATTGATCCATTAACTAGATTTGGTCTA TTGTCAGTTGGAGTAGCACCAAAATAA |
| est amino acid sequence | MT GGGAGGDHSVHIQFCVSUGSKRNFLQVRDWLEQTFPELRGKVTGDNYPPPPIAELLMKFLSVIQLAGMAVALIGENVFRFTGMSRPPSWYGDIVVKNAVPLGIGLYLIVPQILNGYIVSNAFEVVLDGTETIFSKIATGRMPAAEDLIDPLTRFGL LSVGVAPK* |
| est secis free energy | 0 |
| est secis sequence |