| id | 328 |
|---|---|
| protein family | PITH |
| protein name | Fr.cy-PITH-1-U |
| species name | Fragilariopsis cylindrus |
| seq length | 134 |
| cds location | 712694..712626,712339..712007 |
| secis location | 705355..705264 |
| dna sequence | CGACTTGGTTGTAAGAGTGATGCCGATGAACAATTGATTCTTCATTTTGCTTTTCAAGAATCGGTGAAGGTCCATTCCATAAAATTAACAGAATTTAATAATGGTATTGAACCAGAAAATAATCCCACCAGAATTTTATTATTTGTCAATCGTGATAATTTAGGGTTTGAAGATGTAGAGGATGTAGATCCCACCACTGTGATCGAATTAACCTCGGACGATTTAAAAGAAAATGCTGATAATACCTTATTAAAATTTGTGCAATATCAACGTGTGAATAGTATTACAATGTTTGTGGAAGATAATAATGGTGGTGATATTACCGCATTAGGTGCCTTAAAATTCTTTGGTAAAACAGTGGCCACCACGAATATGGCAGATTTTAAAAAACAAGGATGAGGT |
| amino acid sequence | RLGCKSDADEQLILHFAFQESVKVHSIKLTEFNNGIEPENNPTRILLFVNRDNLGFEDVEDVDPTTVIELTSDDLKENADNTLLKFVQYQRVNSITMFVEDNNGGDITALGALKFFGKTVATTNMADFKKQGUG |
| secis free energy | -12.26 |
| secis sequence | AACUGGACGA AAUUGGU UUUGUGUG GUGAU CUACUUCCAA AA AUUGUAAUAACGUUC AUGAGAGUG CGGAA AAAC AUGAAAU GAACAUUCUA |
| est id | gi|282264741|gb|GW081351.1|GW081351 |
| est cds location | 212..613 |
| est secis location | |
| est dna sequence | ATGTTTAGTGGTGCAGAAGCTGGTGGTGCCGCAGCAGCAGCAGCTAGCGGCGATGCCGCTGCTGGTACTAAATTGATTGATTTAACGGATAAGTTAGATAAGAGTGGTTGTTATGCCAGAAATGAAGATACACGTTTTCCATGGACGAATCTGAGTATTGGTGATACT AGACTTGGTTGTAAGAGTGATGCCGATGAACAACTTATTCTTCATTTTGCCTTTCAAGAATCGGTGAAGGTCCATTCCATAAAATTAACAGAATTTAATAATGGTATTGAACCAGAAAATAATCCAACCAGAATTTTATTATTTGTTAATCGTGATAATTTAGGTTTTGAAGATGTGGAGGATGTGGATCCAACCACTGTTATAGAATTAACATCCGAAGATCTAAAAGAAAATGCCGATAACACCTTATTAAAATTTGTTCAATATCAACGTGTGAATAGTATTACCATGTTTGTCGAAGATAATAATGGTGGTGATATTACAGCATTAGGTGCCTTAAAATTCTTTGGTAAAACGGTGGCCACCACGAATATGGCTGATTTAAAAAAACAAGGATGAGGT CTATAA |
| est amino acid sequence | MFSGAEAGGAAAAAASGDAAAGTKLIDLTDKLDKSGCYARNEDTRFPWTNLSIGDT RLGCKSDADEQLILHFAFQESVKVHSIKLTEFNNGIEPENNPTRILLFVNRDNLGFEDVEDVDPTTVIELTSEDLKENADNTLLKFVQYQRVNSITMFVEDNNGGDITALGALKFFGKTVATTNMADLKKQGUG L* |
| est secis free energy | 0 |
| est secis sequence |