藻类硒蛋白数据库

Protein Details

id306
protein familyFeSoxR
protein nameFr.cy-FeSoxR-1-U
species nameFragilariopsis cylindrus
seq length330
cds location434709..433915,433714..433520
secis location433453..433352
dna sequence
AGAAAACAATCAAAAGTATTACAAATTAATATTGGTTTGTATTGCAATCAAGCCTGTGGACATTGTCATGTCGAATCGTCACCATTACGGAAAACGGAAATGATGACGACTGCCACGACGGCACGGTGTTTACAATTATTAAAAAATTCCCCTTCTATTACGACATTAGATATCACTGGTGGTGCACCGGAATTAAATGATAATTTTCGATATTTAGTCAGTACCGCACGTGCGATCCGACCAGATTTAATTATCATTGATCGATGTAATTTAACGGTCTTACAAGAACCTGGTCAACATGATTTAGTCGATTTTTTAAAAGATCATGATGTGACCATCATTGCTAGTTTGCCCTGTTATTCTGAAGATAATGTCGATACACAACGTGGAAATGGTGTCTTTGAACGTTCTATCTCGGCATTATTAGCATTAAATGAAGCAGGATATGGAAAACAAACAGAACATACTACTACTACTACTACTACTACCGGTAGTGAGAATAAGAGTAAAAAATCATTAGTATTGGATTTAGTCTATAATCCATTAGGTGCATTTTTACCACCACCACAAGAAGACTTACAAATACAATATAAAAAACAATTACAAGATAATTTTGGTATACTATTCAATTCCTTATATACCATTACGAATATGCCCATCAAACGATTTGCGGATTTTTTACATCGACGAGATGAATTAAATGAATATATGATGTTACTCGTAAGAAATTTTAATAGTAATACATTAACTAATTTAATGTGTTTAGATACCATTAATATTGGTTGGAATGGAAAGATATATGATTGTGATTTTAATCAACAATTAGGATATGAGATTGGTGCTGATAAAATACATAGTAATGATGGTGATTGTAAAACTGTTTTTGATATCGAATCATTAGATGAATTACTGGATACAAAAATTCGTAATGATAATCATTGTTTTGGTTGTACTGCTGGGATGGGTTCCAGTTGACAAGGTGCCACGGCG
amino acid sequence
RKQSKVLQINIGLYCNQACGHCHVESSPLRKTEMMTTATTARCLQLLKNSPSITTLDITGGAPELNDNFRYLVSTARAIRPDLIIIDRCNLTVLQEPGQHDLVDFLKDHDVTIIASLPCYSEDNVDTQRGNGVFERSISALLALNEAGYGKQTEHTTTTTTTTGSENKSKKSLVLDLVYNPLGAFLPPPQEDLQIQYKKQLQDNFGILFNSLYTITNMPIKRFADFLHRRDELNEYMMLLVRNFNSNTLTNLMCLDTINIGWNGKIYDCDFNQQLGYEIGADKIHSNDGDCKTVFDIESLDELLDTKIRNDNHCFGCTAGMGSSUQGATA
secis free energy0
secis sequence
UUAUUAUGAA ACGAAGCA AAAGUUUUGA AUGAC UUUUUAAAAAAAG AA AUCUUAUUGGU UUUUAUUUUGAAA AUGAA AAAAAAC UCUGUGAU CCAAUCCAUC
est idgi|282255348|gb|GW068124.1|GW068124,gi|33631504|gb|CF269617.1|CF269617
est cds location1..198
est secis location249..353
est dna sequence
AAGATATATGATTGTGATTTCAATCAACAATTAGGATATGAAATTGGTGCGGATAAAATACATAGTAATGATGGTGATTGTAAAACTGTTTTTGATATCGAATCATTAGATGAATTACTGGATACAAAAATTCGTAATGATAATCATTGCTTTGGTTGTACAGCTGGTATGGGTTCCAGTTGACAAGGTGCCACGGCG TAA
est amino acid sequenceKIYDCDFNQQLGYEIGADKIHSNDGDCKTVFDIESLDELLDTKIRNDNHCFGCTAGMGSSUQGATA *
est secis free energy0
est secis sequence
CUUAUUAUGA AACGAAAA ACAAAAGUUUUGA AUGAC UUUUUAGAAAAAG AA AUCUUAUUGGU UUUUAUUUUGAAA AUGAA AAAAAAC UUUGUGAU CCAAUCCAUC